Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930572O03RikQ8C5Y0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms