Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ccdc113Q8C5T8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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