Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q5

Shisa7, Protein shisa-7, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa7Q8C3Q5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa7Q8C3Q5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa7Q8C3Q5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms