Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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