Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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