Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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