Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cxcl16Q8BSU2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cxcl16Q8BSU2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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