Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab3gap2Q8BMG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap2Q8BMG7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms