Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms