Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco3Q8BH01 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco3Q8BH01 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms