Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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