Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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