Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg4bQ8BGE6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms