Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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