Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.5Q85ZW7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.5Q85ZW7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms