Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms