Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cracr2bQ80ZJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms