Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zbed4Q80WQ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Zbed4Q80WQ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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