Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sestd1Q80UK0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms