Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup214Q80U93 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms