Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rims3Q80U57 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms