Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2q1Q7TSS2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms