Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms