Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms