Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim46Q7TNM2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim46Q7TNM2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms