Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx4Q7TNK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx4Q7TNK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms