Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nphp3Q7TNH6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms