Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno2Q7TNB8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms