Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HhipQ7TN16 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms