Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RfflQ6ZQM0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RfflQ6ZQM0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms