Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms