Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NinlQ6ZQ12 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NinlQ6ZQ12 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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