Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms