Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift172Q6VH22 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms