Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms