Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Atp8b3Q6UQ17 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp8b3Q6UQ17 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Atp8b3Q6UQ17 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Atp8b3Q6UQ17 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Atp8b3Q6UQ17 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b3Q6UQ17 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms