Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timd4Q6U7R4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timd4Q6U7R4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms