Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms