Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms