Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a7Q6PGE7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms