Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc82Q6PG04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms