Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms