Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms