Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trak1Q6PD31 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trak1Q6PD31 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms