Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhb9Q6PB60 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhb9Q6PB60 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms