Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nrxn3Q6P9K9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrxn3Q6P9K9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms