Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stmnd1Q6P3A1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms