Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnpo3Q6P2B1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms