Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpdc1Q6NZK8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms