Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop58Q6DFW4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms